"酪氨酸被划入MRD侦测的潜力是完全一致的,想这些成果将一直大大提极高更进一步MRD侦测的功能性能。"
白血病的MRD侦测是一种灵敏且特异的应用领域受控白血病症状体内中都源功能性细胞器(如ctDNA)相较数量的作法。在这种静止状态下,症状没有肉眼可见的皮下,但可能普遍存在标准病理影像作法未侦测到但就此会造成白血病中风的纤小皮下。
MRD,常常称为纤小完好无损皮下(Minimal Residual Disease)。采用“Minimal” (纤小)这个词汇,是因为它在典籍和病理科学家中都来得类似于。不过,“Minimal”这个词汇可能带有“误导功能性”,因为低水准的出血在HRS和外科手术执行者上都也可能带有不可或缺意义。“Measurable”(可测量)一词汇可来得可信地揭示完好无损在病人体内的癌细胞的普遍存在。NCCN指南同时采用了“Minimal Residual Disease”(纤小完好无损皮下)和“Measurable Residual Disease”(可测量完好无损皮下)两个词。
此外,可行功能性学术研究提到有在小分子水准上侦测多种白血病型式的ctDNA举例来说带有病理效用,典籍和病理科学家有时也会采用“Molecular Residual Disease”(小分子完好无损皮下)一词汇。
近几年来,国际间在实质中都基于ctDNA的MRD不确认性评估(ctDNA-MRD)的病理数据库和证据愈加多,开启了实质肿MRD侦测的雨后春笋。实质肿ctDNA-MRD侦测的核心技术流派主要有两大类:
1)Tumor-informed assays(知晓量化)
对原发有组织展开测序以断定症状的特异细胞器变异图谱,然后其设计引物定制panel或采用互换panel展开个功能性化的ctDNA侦测量化。
2)Tumor-uninformed assays(不知晓量化)
也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无须原发有组织,至少也就是说一组预先选定引物/探针其设计的与白血病型式相关的互换panel展开ctDNA侦测量化,;也侦测ctDNA甲基化的同时,辅以ctDNA酪氨酸或片段组学等多组学作法。弥补了有组织检验过剩或受控遗传座过剩或TAT过长等难题。
Tumor-informed assays的核心技术作法来得不符大众的认知,在保证极高特异功能性的必需下,可通过受控多遗传座的sample-level(检验水准)进一步大大提极高其频率,核心技术门槛来得之下不是比如说极高。Tumor-uninformed assays的核心技术作法来得近似于要到滴,通过大大提极高site-level(遗传座水准)侦测频率并辅以ctDNA酪氨酸或片段组学并建构人工神经网络解法进一步大大提极高其频率和特异功能性,核心技术门槛来得之下较低。
2021年4年底29日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“至少采用体内ctDNA侦测结肺白血病状纤小完好无损皮下(MRD)”的篇文章,首次匿名了Guardant Reveal的学术研究数据库:MRD侦测频率约到91%,特异功能性约100%,这些发现支持了至少体内ctDNA-MRD侦测(Tumor-uninformed assays)的潜在病理运用。
2021年8年底13日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流:至少体内ctDNA-MRD侦测的运用前景”的篇文章,在这那时候学术学者们辩论不确认性评估了至少体内ctDNA侦测MRD的潜能,以及将酪氨酸导入到ctDNA侦测的潜在益处。2
Parikh及其同事1 和Taieb及其同事3 辩论了至少体内ctDNA-MRD侦测在结肺癌(CRC)症状中都的潜在病理运用。
▲ ctDNA酪氨酸和甲基化在两项学术研究中都的运用比起(Parikh和Taieb)
结肺癌(CRC)的外科手术即使如此面临着一个挑战,即相当多的CRC症状因要到期疾病中风而过要到死亡。尽管病理采用了标准的基本功能外科手术,但极高不确认性IIIC期CRC症状的5年生存率也至少有53%,究其原因是没有发现检查和上尚未侦测到的纤小完好无损皮下(MRD)。4
以外,仍有鉴于此可信确认哪些症状术后普遍存在MRD,以帮助督导降低或增加基本功能外科手术,并增加治愈的可能功能性,同时最大限度地降低不致外科手术的相关毒功能性。
在过去的几年那时候,我们对ctDNA在CRC检验和HRS中都的运用有了广泛的了解。以外,基于ctDNA的MRD不确认性评估于是以广泛运应用领域白血病的外科手术中都。
ctDNA是由DNA的短片段都是由(大约130-150bp),由癌细胞通过凋亡、水肿或分泌无罪释放到肺部中都。 ctDNA的半衰期短致使其视为寻常常的实时负荷标志物,它的普遍存在可能反映了检查和上空无一物的纤转到。
在治愈功能性外科手术结束后,ctDNA中都显现的体细胞甲基化对随后的检查和中风带有较低的阳功能性真设实用价值,比如说是当这些甲基化与切掉的有组织中都的甲基化除此以外时。侦测这种ctDNA定义的MRD可以在I-III期CRC中都提前结束检查和数年底真设中风,从而为一组就此会中风的CRC症状缺少一个不确认性评估新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基本概念甲基化定义的MRD侦测作法的频率即使如此是有限的,有鉴于此改良其侦测功能性能。
ctDNA的酪氨酸侦测胜过ctDNA的基本概念甲基化侦测。ctDNA的酪氨酸精神静止状态在CRC中都非常常常常见,并被视为大多数癌变的要到期收尾。这种酪氨酸,具体定义为DNA中都胞嘧啶的C5位置添加甲基配体,缓冲附近遗传的表约,之外经典的抑转录失活。与基本概念甲基化来得,CRC中都普遍存在来得多的酪氨酸精神静止状态区域,为大大提极高MRD侦测的频率缺少了机会。SEPT9,就是第一个利用体内侦测单遗传酪氨酸精神静止状态展开滴查和要到期侦测CRC的作法。尽管ctDNA酪氨酸有这些优点,但这些相同的特功能性也并不需要行事,以保有侦测量化的特异功能性,并尽量降低真阳功能性的可能功能性。
在这种历史背景下,Parikh和Taieb的总括最新学术研究结果为我们对ctDNA功能性能的理解缺少了感兴趣的补充,即无须原发有组织,至少通过体内ctDNA酪氨酸或联合ctDNA甲基化即可展开可信的MRD不确认性评估。与其他并不需要对原发有组织展开测序以督导紧接著ctDNA量化的侦测不同,总括学术研究阐述了Tumor-uninformed assays的有效功能性,它有几个优势,之外快速的TAT,降低初始成本,对有组织过剩或不可用的症状展开受控。
Parikh等人缺少了一种ctDNA酪氨酸建构ctDNA基本概念甲基化的互换panel展开MRD的量化不确认性评估(NGS作法),与其他商业上可用的MRD侦测作法来得,这种作法不并不需要切掉的有组织以及定制化。在就此外科手术后采用时,这种至少体内ctDNA-MRD侦测对中风带有病理意义的特异功能性(100%)和频率(55.6%),通过导入一般说来细胞器特质和横向受控量化,其频率可进一步大大提极高至91%。1 该作法被应用领域于是以在展开的前瞻功能性学术研究,之外督导IIA期结肠癌外科手术执行者的NRG合作开发组学术研究(NCT04068103)。虽然还并不需要额外的数据库集来验证这些发现,但这些结果说明了基于ctDNA的MRD侦测在不知晓的完全可接受的侦测功能性能特质。
Taieb等人的学术研究利用了一对先前被推论是CRC切掉后HRS相关的酪氨酸遗传标记物WIF1和NPY(ddPCR作法),并将它们运应用领域PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC症状随机包含3个年底 vs 6个年底的基本功能化疗。在对受邀III期试验的III期CRC症状展开的首次ctDNA-MRD不确认性评估中都,有13.8%的症状术后为ctDNA-MRD阳功能性,并被确认为独立的HRS标志物。3 同时,学术学者也提到有,与其他采用NGS作法的ctDNA-MRD学术研究来得,本学术研究中都ctDNA的阳功能性率较低。频率和PPV举例来说低于NGS侦测结果,ctDNA-MRD阳功能性和阴功能性的5年DFS分别为65%和73%,尽管基本功能外科手术的和不理想的前量化检验处理可能会对这些结果造成严重影响。该作法都有的是其相较简单,非常常低的成本和潜在的重现功能性,不并不需要商业侦测中都所见的专利技术侦测作法。于是以在展开的前瞻功能性学术研究将进一步不确认性评估至少体内ctDNA侦测是否能够可信不确认性评估MRD,以便对CRC症状展开不确认性分层,并督导基本功能外科手术执行者。
无论采用何种作法,至少用体内ctDNA-MRD侦测来督导CRC症状的外科手术要求,并不需要可信且可信的侦测作法。需进一步大大提极高至少体内ctDNA-MRD侦测的频率来确认哪些症状可以从外科手术降级中都获益,以避免不恰当地选择极高危症状接受较低强度的外科手术。Parikh及其同事的学术研究结果提到有,导入细胞器和一般说来细胞器以及横向体内受控,可显著大大提极高至少体内ctDNA-MRD的频率。来得之下,ctDNA-MRD侦测的极高特异功能性对于ctDNA作为一个零碎的生物标志物来确认外科手术换用是至关不可或缺的。由于特异功能性过剩,真阳功能性的ctDNA-MRD可能会使症状接受不致的强化外科手术。Parikh及其同事的学术研究结果推论,除基本概念甲基化外,还可以通过建构一般说来细胞器酪氨酸特质的量化来保有特异功能性。Taieb等人的量化作法的优势在于大大提极高了病理特质的频率和HRS,但是,于是以如学术学者承认的那样,单独的两个遗传酪氨酸标记可能未缺少与建构基本概念甲基化作法的功能性能特质。不可或缺的是,这项工作也突显了标准化量化前条件的不可或缺功能性,因为各种所含作法可以在不小程度上严重影响ctDNA的得率和零碎功能性。在尚未来的学术研究中都,这些量化前的选择将变得愈加不可或缺。
酪氨酸被划入MRD侦测的潜力是完全一致的,想这些成果将一直大大提极高更进一步MRD侦测的功能性能。总之,至少体内ctDNA-MRD的侦测缺少了一个独特的机会,采用一种无创作法来探索外科手术方案,并有可能根除极高危症状的纤转到功能性皮下。这些学术研究结果却是为尚未来ctDNA-MRD督导的前瞻功能性病理试验迈出了道路。
MRD,即使如此是一个快速发展的领域,我们下半年近两年可能会显现在此之后证据,要么表明出有MRD侦测的病理效用的局限功能性,要么表明出有MRD侦测的其他优势和新用具。
参考资料:
1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.
3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.
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